Biophysics

Názov v sekundárnom jazyku práce: The effect of selected pesticides on the genetic material of cells.

Anotácia v hlavnom jazyku práce: Používanie pesticídov predstavuje pretrvávajúci ekologický problém, preto je potrebné skúmať ich pôsobenie na rôznych úrovniach živých organizmov. V súčasnosti sa mnohé vedecké pracoviská zaoberajú účinkom týchto toxických látok z viacerých pohľadov, napríklad z pohľadu ich genetického pôsobenia alebo účinkov na vznik voľných radikálov v tkanivách. Dizertačný projekt je zameraný na skúmanie interakcií molekúl pesticídov s genetickým materiálom eukaryotických buniek, ktorým budú v prvej etape lineárna a kruhová DNA. Ďalším cieľom sú históny - malé bázické proteíny, ktoré vytvárajú jadro nukleozómov nachádzajúcich sa v bunkovom jadre. Jadro nukleozómu tvorí tzv. histónový oktamér obalený kruhovou DNA, na ktorý sa zameriame po získaní výsledkov z predchádzajúceho štúdia. Úlohou doktoranda bude biofyzikálnymi, fyzikálno-chemickými a termodynamickými metódami určiť spôsob a silu interakcie medzi molekulami pesticídov a hore uvedenými objektami. Pri riešení projektu sa budú využívať metódy zahrňujúce absorpčnú, fluorescenčnú, infračervenú spektroskopiu, priestorové spektrá, optický dichroizmus, kalorimetriu a v spolupráci s Ústavom genetiky aj genetické metódy.

Anotácia v sekundárnom jazyku práce: The use of pesticides is a persistent ecological problem, so it is necessary to study their action at different levels of living organisms. At present, many scientific institutions deal with the effect of these toxic substances from several perspectives, for example from the point of view of their genetic action or effects on the formation of free radicals in tissues. The dissertation project is focused on investigating the interactions of pesticide molecules with the genetic material of eukaryotic cells, which will be in the first stage of linear and circular DNA. Another target are histones - small basic proteins that form the nucleus of nucleosomes located in the cell nucleus. The nucleosome nucleus consists of the so-called histone octamer, enveloped by circular DNA, which we will focus on after obtaining the results from the previous study. The task of the PhD student will be to determine by biophysical, physico-chemical and thermodynamic methods the mode and strength of interaction between pesticide molecules and the above-mentioned objects. The project will use spectrophotometric methods such as absorption, fluorescence, infrared spectroscopy, spatial spectra, optical dichroism, calorimetry and, in cooperation with the Institute of Genetics, genetic methods.

Školiteľ: Staničová, Jana, doc. RNDr. PhD.